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離子色譜法測定無機陰離子時，不被色譜柱保留或弱保留的陰離子干擾F-和Cl-測定時，用強淋洗液進行洗脫。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中的水溶性陰離子時，采樣濾膜可選用優(yōu)質(zhì)空白值較低的玻璃纖維、石英或其它材質(zhì)的濾膜，并能滿足顆粒物采樣技術(shù)要求的產(chǎn)品。
《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）的樣品采集與保存規(guī)定，采集的樣品應經(jīng)0.45μm微孔濾膜過濾，其濾液不加任何保存劑，收集于聚乙烯或玻璃瓶內(nèi)，在0℃~4℃下可保存48h。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）中的水溶性陰離子是指環(huán)境空氣顆粒物樣品，在不加化學試劑的情況下用去離子水溶解的陰離子。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜全程序空白試樣的制備是使用與樣品采集同批次的空白濾膜，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣中氯化氫時，將微孔濾膜裝在濾膜夾內(nèi)，后面串聯(lián)兩支各裝10ml吸收液的大型氣泡吸收管，用空氣采樣器進行采樣。
在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）的吸收液要臨用現(xiàn)配。
《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）適用于地表水、地下水和降水中總磷酸鹽的測定。