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在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，每次采集樣品應(yīng)至少帶兩套全程序空白樣品。將同批次裝好吸收液的吸收瓶帶至采樣現(xiàn)場，不與采樣器連接，采樣結(jié)束后帶回實驗室待測。
《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）的吸收液要臨用現(xiàn)配。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）中的水溶性陰離子是指環(huán)境空氣顆粒物樣品，在不加化學(xué)試劑的情況下用去離子水溶解的陰離子。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中的水溶性陰離子時，采樣濾膜可選用優(yōu)質(zhì)空白值較低的玻璃纖維、石英或其它材質(zhì)的濾膜，并能滿足顆粒物采樣技術(shù)要求的產(chǎn)品。
離子色譜的電導(dǎo)檢測器內(nèi)，電極間的距離G越小，死體積越小，則靈敏度越低。
《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）的質(zhì)量保證和質(zhì)量控制規(guī)定，吸收瓶的吸附效率是第一支吸收瓶所收集組分與兩支吸收瓶共收集組分質(zhì)量的比值，以百分比計。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣降塵中的水溶性陰離子時，為了防止樣品變質(zhì)或冰凍，須在集塵缸內(nèi)加入硫酸銅、防凍液等。
《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）的樣品采集與保存規(guī)定，采集的樣品應(yīng)經(jīng)0.45μm微孔濾膜過濾，其濾液不加任何保存劑，收集于聚乙烯或玻璃瓶內(nèi)，在0℃~4℃下可保存48h。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜全程序空白試樣的制備是使用與樣品采集同批次的空白濾膜，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。